Tipico esempio di Lago Carsico, il lago di Doberdò e' privo sia di immissari che di emissari.
Collocato in una vallata in mezzo all' altipiano del Carso, le acque vi affuiscono per resurgiva e con la pioggia, mentre ne defluiscono solo per assorbimento del terreno ed evaporazione.
L' afflusso idrico è legato ad un complesso sistema idrogeologico sotterraneo, e constra di polle e resurgive alimentate dalle aqcue dell' Isonzo e del Timavo.
Analogamente il deflusso avviene tramite caditoie formatesi verso falde e cavità sotterranee che garantiscono il deflusso delle acque verso il mare.
Il livello delle acque è molto variabile in rapporto alla piovosità ed ad altri fattori e talora il lago pare ridotto ad una palude di piccole pozze.
La particolarità del fenomeno ha creato un microclima di notevole interesse scientifico e naturalistico, tanto che il lago è una delle sette riserve naturali protette dal Carso.